比赛主要有两种流程。第一种比赛流程是依次进行神秘盒挑战、创意菜比拼、以及压力测试；第二种比赛流程则包括团队赛、技能测试、以及压力测试。 播出时间：2012年7月29日-10月14日（每周日21:15，共11期）
播出平台：东方卫视
美食评审：曹可凡、刘一帆、李宗盛 播出时间：2013年1月16日-2013年4月4日（正式赛）每周三、周四22:00
播出平台：东方卫视
播出集数：24集
美食评审：曹可凡、刘一帆、梁子庚
明星观察员：萧蔷、任贤齐、蔡少芬、李宗盛等
3月28日，第二季的五强选手分别和上一季的五强，分别进行对决，
赵丹VS黄莺（面）----败
王小草VS范恬恬（鸡)----胜
洪宏星VS李靓（海参）---平
纪晓光VS顾晓光（粥VS饭）----败
谢航VS魏翰（意面）-----败
结果1胜，1平，3败。王小草、洪宏星安全，赵丹由于上一次的表现，获得豁免权。谢航，纪晓光进入压力测试。压力测试，做马卡龙 macaron（又称作法式小圆饼），配料简单却很难做的殿堂级甜点。他们两个做的都不是很好，最后纪晓光晋级，谢航遗憾止步四强。 拥有“中国顶级厨师”头衔的赵丹的故事似乎一夜之间便流传开来，人们纷纷谈论着这个80后女子的事迹。
在新东方烹饪学校，赵丹更是成为众人关注的焦点。不仅是因为《顶级厨师》是一档美食节目，更因为赵丹是他们的学姐。赵丹是新东方烹饪学院2012届西点专业学生。4月4日晚，赵丹获胜的消息一经传出，江西新东方烹饪学校的学子们立刻沸腾了，他们为他们的励志学姐高兴、喝彩。在成都新东方烹饪学校，许多在校学子将赵丹学姐比作自己的榜样，表示要努力学习厨艺，将来要像赵丹学姐一样成为中国的顶级厨师。